L'islam chiite duodécimain est la religion officielle de l'Iran et celle de la grande majorité des habitants de Téhéran.
Les chiites représentent environ 89 pour cent de la population du pays et les sunnites environ 10 pour cent. Le chiisme duodécimain reconnaît douze imams successeurs du Prophète dans la lignée d'Ali. La figure de l'imam Hussein, tué à Kerbala en 680, occupe une place centrale et donne lieu chaque année aux commémorations de mouharram. Depuis 1979, le clergé exerce à la fois une autorité religieuse et une autorité politique, le Guide suprême se trouvant au sommet des institutions.
Les mosquées de quartier organisent la vie religieuse locale et les cortèges de deuil. L'Imamzadeh Saleh, à Tajrish, est le sanctuaire le plus fréquenté du nord de la ville. La grande prière du vendredi se tient sous la conduite d'un imam nommé par le Guide suprême. Pendant le ramadan, boire, manger et fumer en public dans la journée sont interdits, et la plupart des restaurants n'ouvrent qu'après le coucher du soleil. Le degré de pratique varie fortement d'un quartier et d'un milieu à l'autre.
La constitution de 1979 reconnaît trois minorités religieuses non musulmanes, les zoroastriens, les juifs et les chrétiens. Elles accomplissent leurs rites, gèrent leurs écoles et leurs institutions, et disposent de sièges réservés au Parlement, qui compte 290 députés.
Les chrétiens d'Iran, arméniens et assyriens pour l'essentiel, sont estimés à environ 300 000 personnes, les zoroastriens entre 35 000 et 60 000, les juifs entre 20 000 et 30 000. Téhéran abrite des églises arméniennes, dont la cathédrale Saint-Sarkis, et une dizaine de synagogues en activité.
La foi bahaïe est née en Iran au XIXe siècle. Elle ne figure pas parmi les minorités reconnues par la constitution et ne dispose d'aucun statut légal. Ses membres font l'objet de restrictions, notamment dans l'accès à l'enseignement supérieur et à certains emplois.
Dans l'espace public, les femmes se couvrent les cheveux et portent des vêtements longs et amples. La règle vaut pour les étrangères comme pour les Iraniennes. L'entrée dans un lieu de culte islamique suppose un voile couvrant les cheveux et le corps jusqu'aux chevilles, en général prêté sur place. Les hommes portent un pantalon long et une chemise à manches longues. L'alcool est interdit à la vente et à la consommation publique, et son importation est prohibée.